Approche syndromique multiplexe en réanimation

Multiplex PCR syndromic testing in intensive care units

¹ Laboratoire de Bactériologie, Hôpital Bichat Claude Bernard, HUPNVS, AP-HP, 46 rue Henri Huchard, F-75877 Paris cedex 18, France
² Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat Claude Bernard, HUPNVS, AP-HP, 46 rue Henri Huchard, F-75877 Paris cedex 18, France
³ Paris University, IAME, Inserm, Paris, France

^* e-mail : laurence.armand@aphp.fr

Reçu : 26 Février 2019
Accepté : 26 Mai 2019

Résumé

Le développement récent des nouveaux tests de diagnostic rapide par PCR multiplexe à visée syndromique, capables de détecter plusieurs dizaines de pathogènes en quelques heures, a entraîné un changement de paradigme en microbiologie et en pratique clinique. Plusieurs d’entre eux, comme les panels pour détecter les germes en cause dans les bactériémies, les infections respiratoires hautes ou basses et les méningoencéphalites, sont déjà disponibles et peuvent apporter une aide dans le diagnostic des infections chez les patients de réanimation. Bien que ces nouvelles techniques présentent des avantages évidents pour le dénombrement de micro-organismes et parfois pour la détection simultanée de gènes de résistance, pour les délais d’exécution et de rendus de résultats, elles présentent cependant certains défis, comme l’évaluation de leurs performances réelles, leur coût très élevé, le choix des stratégies d’utilisation et l’interprétation clinicobiologique des résultats. Dans cet article, nous avons passé en revue les différents tests qui peuvent ou pourront aider les réanimateurs dans leur pratique quotidienne, relevé leurs limites et leur impact bénéfique potentiel sur le soin des patients.

Abstract

The recent development of multiplex PCR syndromic assays, able to detect dozens of pathogens within a few hours, has led to a paradigm shift in microbiology and clinical practice. Several of them, such as the panels detecting pathogens responsible for bacteremia, high or low respiratory infections or meningoencephalitis, are already available and can be used to help in the diagnosis of infections among intensive care units patients. Although these new techniques have obvious advantages such as the high number of microorganisms simultaneously tested, detection of resistance genes, and very short delay of results, they also present strong challenges, such as their exact performance assessment, their high cost, the best strategies of use and sometimes complex interpretation of the results. In this article, we review the different panels of syndromic assays currently available that can or will help ICU physicians in their daily practice. We will highlight both their limitations and their potential beneficial impacts on patient care.